Genomic Targets for Comparative Sequencing



Targets for Organism: dog

Target Human Chromosome
Reference		 Size in Human
(Mb)		 ENCODE Region Representative Gene(s) in Region 
1  Map  7q31  ~1.5  ENm001  CFTR, WNT2, MET, ST7 
2  Map  7q11, 7q22  ~3.0    ELN, LIMK1, p47-PHOX, ZPA3 
3  Map  7q21  ~5.8    CDK6, COLIA2, PEX1 
4  Map  7p14-p15  ~5.0    AQP1, GHRHR 
5  Map  7q31-q32.1  ~4.0    LEP, PAX4, ARF5, BCP 
6  Map  21q22.11  ~1.4  ENm005  GCFC, INFAR1/2, SON, ITSN 
7  Map  13q22.3  ~0.2    EDNRB 
8  Map  10q11.21  ~0.3    RET 
9  Map  6p12.1  ~0.4    BMP5 
11  Map  8q22.1  ~0.2    GDF6 
12  Map  16p13.3  ~0.1  ENm008  Alpha Globin Cluster 
13  Map  11p15.5  ~0.1  ENm009  Beta Globin Cluster 
14  Map  9p21  ~0.5    IFNB 
15  Map  10p14  ~0.2    IL2R 
16  Map  14q24.3  ~0.1    FOS 
17  Map  1p31-p32  ~0.1    JUN 
21  Map  17p12  ~0.2    p53 
23  Map  19q13.2  ~0.2    Creatine Kinase 
24  Map  19q13.33  ~0.7    SigLec Cluster 
25  Map  2q24.3  ~1.3    SCN9a, SCN1a, SCN2a, SCN3a 
26  Map  7p22.3  ~0.2    Lunatic Fringe 
27  Map  3q29  ~0.2    HES1 (HRY) 
28  Map  12q21.31  ~0.6    MYF5 
29  Map  2q32.2  ~0.5    GDF8 
30  Map  8q21.13  ~0.3    HRT1 (HEY1) 
34  Map  10q23.2  ~0.1    OPN4 
35  Map  5p13.3  ~0.2    AIM-1 
36  Map  4q11  ~0.2    C-KIT 
38  Map  Xp22.2  ~0.3    M6B 
39  Map  3p14.1  ~0.1    MITF 
40  Map  2q35  ~0.2    PAX3 
42  Map  22q13.1  ~0.1    SOX10 
47  Map  16q12.1  ~0.2    CARD15, CYLD 
48  Map  10q26  ~0.3    GFRA1 
49  Map  8p21  ~0.1    GFRA2 
50  Map  5q31  ~0.1    GFRA2, CDC25C 
79  Map  20  ~0.5  ENr333   
89  Map  17q25  ~0.3    Otop2-3 
90  Map  4p16.3  ~0.4    Otop1 
92  Map  22q13.1  ~0.9     
93  Map  1  ~0.3    FOXD3 
94  Map  7  ~0.2    GPNMB 
96  Map  1  ~0.1    MPZ 
97  Map  15  ~0.2    TRPM1 
98  Map  12  ~0.2    SILV 
99  Map  1q21  ~0.1    GBA, MTX1 
100  Map  11p15.5  ~0.4    LIT1 
101  Map  6q24.2  ~0.2    HYMAI, ZAC 
102  Map  14q32.2  ~0.2    DLK1 (GTL2) 
103  Map  22q12.3  ~0.3    ApoL 

 

 

 

 

NISC Bioinformatics Team
Last modified: Thu Apr 28 10:38:32 EDT 2005